از کجا می توانیم دیتاهای NGS را بدست بیاوریم؟

شما می توانید داده های مورد نظرتان را خودتان تولید کنید اما بسیاری از داده ها NGS در اینترنت نیز وجود دارد. بررسی کنید شاید کسی این ازمایش شما را را قبلا انجام داده است در نتیجه در وقت و پول شما صرفه جویی می شود چهار مخزن اصلی برای داده های NGS وجود دارد.

 

1) آرشیو SRA از NCBI
مخزن فایل های داده های خام به فرمت SRA، که FASTQC را قبول نمی کند.


⁣http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra

2) آرشیو GEO در NCBI
مخزن حاوی داده های پردازش شده که از آزمایش های بیان ژنی مانند RNA-Seq, ChIP-Seq بدست امده اند.


http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

3) آرشیوی ENV از EBI
مخزن فایل های داده های خام به فرمت FASTQC

⁣http://www.ebi.ac.uk/ena

4) آرشیوی ArrayExpress از EBI
مخزن حاوی داده های پردازش شده که از آزمایش های بیان ژنی مانند RNA-Seq, ChIP-Seq بدست امده اند.


⁣http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress