داروهای کووالانسی طی چند سال اخیر به عنوان مشکل بزرگی در بخش های R&D بوده اند. موضوع گروه های واکنشی فعال در ملکول های کوچک و نحوه برهمکشن آن ها با سیستم های حیاتی و ملکول های زیستی همراه با پیچیدگی های جالبی بوده است.
هم اکنون گروه Shoichet در UCSF به دستاوردهای محاسباتی مفیدی در این زمینه رسیده اند. آن ها DOCKovalent که یک پایگاه غربالگری مجازی برای مهارکننده های کووالانسی است را گزارش دادند و آن را با مثال هایی از سیانوآکریل آمیدها و برونیک اسیدها برروی چندین آنزیم مختلف معرفی کرده اند.
محاسبات بر اساس زوایای مورد نیاز برای واکنش بین یک الکتروفیل با یک اسید آمینه مانند سیستئین می باشد. با اجرا برنامه با استفاده از مهار کننده های شناخته شده انزیم های مختلف در مقابل مولکول های Decoy نشان داد که غربالگری مجازی به ما مجموعه Hit می دهد. همانند هر تکنیک دیگری .این تکنیک نیز گاهی مواقع (به ما جواب صحیحی نمی دهد)به شکست می انجامد. گروه Shoichet این ابزار را تحت وب به صورت رایگان در اختیار ما قرار داده اند .
لینک دسترسی به این ابزار
Decoy