دوره های آموزشی در حال حاضر آزمایشگاه پارس سیلیکو در زمینه های طراحی دارو، انالیز RNA seq ، بیوانفورماتیک عمومی، بیوانفورماتیک ساختاری و بیوانفورماتیک سرطان می باشد

 برنامه پاییز

• دوره کارآموزی طراحی دارو
  

مدت دوره: 6 هفته 20 جلسه

هزینه دوره: 750 هزار تومان

شروع دوره:۱۸ بهمن ماه  چهارشنبه عصر ( ظرفیت : 5 نفر )

سرفصل‌ ها:

قدمه اي بر طراحی دارو
آشنایی با انواع روش های طراحی دارو (براساس ساختار،بر اساس لیگاند)
آشنایی با فرمت های مختلف مولکولهای شیمیایی
آشنایی با انواع دیتابیس های دارویی
آشنایی با دیتابیس های ماکرومولکولی
مبانی تئوری داکینگ، اصول غربال گري مجازي
آشنایی و آموزش روش های طراحی و بهینه سازی مولکولی
 آموزش بهینه سازی و آماده سازی ماکرو مولکول
آشنایی و آموزش Autodock و Vina
آموزش داکینگ بروی پروتئین
آموزش کار با LIGPLOT
آموزش استخراج و آنالیز نتایج
آموزش استفاده از PyRx برای غربالگری مجازی
آموزش کار با LIGPLOT+
 آشنایی و آموزش openbabel
آموزش غربالگری مجازی فارماکوفوری ساختار محور باZincPharmer
آموزش غربالگری مجازی فارماکوفوری لیگاند محور با PharmaGist
آموزش غربالگری مجازی بر اساس شکل ساختار محور با Pharmit

• دوره کارآموزی انالیز بیان ژن (Microarry و RNA-seq )
  

مدت دوره: ۶ هفته ۲۰ جلسه

هزینه دوره: ۸۵۰ هزار تومان

گروه اول: ( روز برگزاری پنجشنبه - صبح )  (ظرفیت: ۵ نفر )

شروع دوره: ۱۹بهمن ماه

سرفصل‌ ها:

• آموزش مفاهیم آماری مرتبط با آنالیز بیان ژن انواع خطا، p-value، آزمونهای t، آزمون Z

• آشنایی با محیط نرم افزاری R، نحوه نصب پکیجها بر روی R، آموزش وارد کردن داده ها به R و نحوه گرفتن داده ها

• آموزش محاسبات آماری در R، آشنایی با برخی پکیجهای مرتبط مثل limma

• آنالیز داده های میکرواری، نحوه آنالیز داده های موجود در GEO و کشیدن نمودارهای مربوط مانند heatmap

• آشنایی مقدماتی با لینوکس و بایو لینوکس

• آشنایی با آنالیز داده های توالی یابی RNAseq، آموزش پکیج های و ابزار های مرتبط

• آموزش آنالیز RNAseq با وب سرور Galaxy

• غنی سازی ژنی

• آموزش Cytoscape

• رسم و تحلیل شبکه های هم بیانی

• دوره زیست شناسی سامانه ای
  

مدت دوره:  ۵ هفته ۱۵ جلسه

هزینه دوره: ۷۵۰ هزار تومان

شروع دوره:۱۹ بهمن

روزهای برگزاری: پنجشنبه عصر ( ظرفیت : ۵ نفر )

• سرفصل‌ ها:

•مقدمه ای بر زیست شناسی سامانه ای
•انالیز شبکه در زیست شناسی سامانه ای
•آموزش cytoscape
•آموزش رسم شبکه هم بیانی
•آموزش رسم شبکه دارو تارگت
•آموزش رسم شبکه پروتئین پروتئین
•آموزش رسم شبکه میکرو ار ان ای ژن
•آموزش ابزار CellDesigner و متلب
•فارماکولوژی سامانه ای دارویی
•زیست شناسی سامانه ای سرطان
•زیست شناسی سامانه ای سلول های بنیادی
•مدل سازی دینامیک در زیست شناسی سامانه ای

• دوره کارآموزی بیوانفورماتیک عمومی
  

مدت دوره: ۶ هفته ۱۸ جلسه

هزینه دوره: ۷۵۰ هزار تومان

شروع دوره: دی ماه

سرفصل‌ ها:
بیوانفورماتیک مقدماتی
بیوانفورماتیک ساختاری
طراحی دارو مقدماتی
طراحی پرایمر
بایو لینوکس
سیستم بیولوژی
فیلوژنی مولکولی
و..

گروه اول : ( روز برگزاری چهارشنبه ۱۵ تا ۱۹:۳۰)  (ظرفیت: 6 نفر )

• دوره کارآموزی بیوانفورماتیک ساختاری
  

مدت دوره: ۶ هفته  ۲۰ جلسه

هزینه دوره: ۸۵۰ هزار تومان  

شروع دوره:  بهمن

سرفصل‌ ها:

بیوانفورماتیک ساختاری
مدلسازی و مهندسی پروتئین
داکینگ پروتئین - لیگاند
داکینگ پروتئین - پروتئین
دینامیک مولکولی

گروه اول : ( روز برگزاریسه شنبه-  عصر)  (ظرفیت: 6 نفر )

• دوره کارآموزی زبان برنامه نویسی پایتون ( بایو پایتون )

مدت دوره 1 ماه 12 جلسه

هزینه دوره 450 هزار تومان

شروع دوره  آذر ماه

گروه اول ( روزهای برگزاری پنجشنبه صبح ) 

(ظرفیت: 5 نفر )

 سرفصل‌ ها

آشنایی با زبان برنامه نویسی پایتون، اصلاحات و مفاھیم، نصب و راه اندازیپایتون و پکیج ها، نحوه استفاده از پکیج ها و کتابخانه

1 در جلسات ابتدایی، شما خواهید آموخت که چرا پایتون انتخاب مناسبی برای زیست شناس ها و مبتدیان است. همچنین می آموزید که چگونه پایتون را بر روی سیستم عامل خود نصب کنید و نیز چگونه محیط برنامه نویسی خود را تنظیم کنید. این جلسات با مرتبط کردن شما با تمام نرم افزارهای رایگان مورد نیاز شما تکمیل می شود.
2 در ادامه، شما خواهید آموخت که چگونه می توانید مانند توالی های DNA و پروتئین را دستکاری کنید و چگونه اشتباهاتتان در برنامه نویسی را برطرف کنید. مثال: محاسبه ی محتوای GC و AT، تبدیل توالی DNA و RNA به یکدیگر و پروتئین. و..
3 در بخش سوم، چگونگی خواندن و نوشتن داده ها در فایلها را فرا خواهید گرفت. همچنین می آموزید که چگونه با مسیرهای فایل ها و فرمت فایل FASTA دست و پنجه نرم کنید. مثال: تقسیم DNAی ژنومی، نوشتن یک فایل FASTA. و..
4 می آموزید که چگونه در یک برنامه واحد، قسمت های مختلف و زیادی از داده ها را پردازش کنید و با ابزارهای پیشرفته تری برای دستکاری توالی ها آشنا خواهید شد. مثال: مقایسه و الایمنت توالی ها، تریم کردن (پیرایش) توالی ها، الحاق اگزون ها. پیدا کردن موتیف ها و..
5 همچنین، خواهید آموخت که چگونه با خلق دستورالعمل های شخصی خودتان، می توانید پایتون را مفیدتر کنید و نیز بهترین راه ارزیابی آن دستورالعمل ها در جهت بالا بردن سرعت کار را فرا می گیرید. مثال: تحلیل ترکیب آمینواسیدی توالی پروتئین. ابزار تحلیل متون و مقالات موجود در pubmed  و..

ثبت نام و پرداخت شهریه از طریق لینک زیر

مخاطبان دوره:

فارغ التحصیلان و دانشجویان کارشناسی، کارشناسی ارشد، و دکترای انواع گرایش های زیست شناسی، شیمی، داروسازی، پزشکی،  بیوتکنولوژی پزشکی و دارویی، میکروبیولوژی، کشاورزی، ژنتیک، باکتری شناسی، ویروس شناسی، ایمونولوژی، قارچ شناسی، انگل شناسی، بیوشیمی،پزشکی مولکولی،  فرآورده های بیولوژیک و محققین مشغول در تحقیقات دارویی، پزشکی و کشاورزی

برای اطلاع بیشتر لطفا از طریق شماره تلفن های آزمایشگاه با ما تماس بگیرید