کارگاه های آموزشی زمستان

آزمایشگاه پارس سیلیکو با توجه به رسالت خود که معرفی و آموزش علوم زیست شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک به جامعه اکادمیک کشور می باشد.اقدام به برگزاری دوره های تخصصی و کارگاه های آموزشی، در این زمینه کرده است. لذا  مجموعه کارگاه های زمستان این آزمایشگاه به شرح زیر می باشد.

ادامه مطلب

دورنمای تکنولوژی توالی یابی در سال 2017

سال جدیدی پیش روی ماست! از انجایی که کنفرانس J.P. Morgan یک هفته دیگر شروع می شود و کمی بعدتر هم نوبت AGBT خواهد بود. پس فرصت زیادیب رای پیش بینی وقایع نداریم، و از همین الان هم اعلان ها و فراخوان ها شروع شده اند. نکته ی کلیدی برای پیش بینی سال 2017، تغییر مدیریت سیاسی در ایالات متحده است. هر گونه تغییری در دولت مانند موجی در سیاست گذاری های علمی نفوذ می کند.

ادامه مطلب

ژنومیک و کلان داده در پزشکی

یکی از چالش های بزرگ و در عین حال فرصت های بزرگ در دهه ی پیش رو، تلفیق سنجش مولکولی و تحلیل داده های همراه آن، با پزشکی عمومی خواهد بود. البته این امر برای ژنتیک پزشکی و دیگر رشته های خاص، امر تازه ای نیست اما با آغاز تلاش های پزشکی و دسترسی به اطلاعات غنی حاصل از ژنومیکس، ترانسکریپتومیکس و متابولومیکس، مسایل پیچیده تری در یکپارچه سازی و بکارگیری آنها در برابر ما قرار خواهد گرفت. هم از نظر علمی و هم از نظر اجتماعی این امر جالبی است که یک موج بزرگ تکنولوژی دارد ما را به سمتی سوق می دهد که از تلاقی داده های مولکولی، تصویربرداری با قدرت تفکیک بالا و ابزارهای سنجش مداوم، کاربردهای پزشکی مفیدی را خلق کنیم.

ادامه مطلب

آیا دعوا بر سر توالی یابی با خوانش های بلند پایان یافته است؟

از اشتیاق من به توالی یابی نانوحفره (nanopore) مطلع هستید. ما تعدادی نرم افزار برای کار کردن با داده های آن داریم. ما یک بودجه ی پژوهشی برای این کار را دریافت کردیم و یک ژنوم باکتریایی بسیار مشکل را با موفقیت اسمبل کردیم. این موارد باعث شد تا من یک مقاله برای Nature Methods بنویسیم. بنابراین مقداری طرفداری نسبت به MinION از سوی من وجود دارد.

ادامه مطلب