کارگاه و دورهای آموزشی پاییز

آزمایشگاه پارس سیلیکو با توجه به رسالت خود که معرفی و آموزش علوم زیست شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک به جامعه اکادمیک کشور می باشد.اقدام به برگزاری دوره های تخصصی و کارگاه های آموزشی، در این زمینه کرده است. لذا  مجموعه کارگاه های پاییز این آزمایشگاه به شرح زیر می باشد.

ادامه مطلب

معرفی نرم افزار HEX

برنامه HEX یک برنامه برای داکینگ  پروتئین – پروتئین  و DNA می باشد که توسط دیوید ریتچه طراحی شده . نرم افزار HEX ساختارهای پروتئین و DNA را به فرمت PDB  دریافت می کند .این  نرم افزار برای سیستم عامل های ویندوز، لینوکس و مک قابل نصب و اجرا می باشد.

ادامه مطلب

ویژه: کارگاه انالیز داده های NGS

به اطلاع اساتید ، دانشجویان و محققان عزیز می رساند که آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو در نظر دارد کارگاه سه روزه انالیز داده های توالی یابی نسل جدید را در روزهای 13 الی 15 شهریور ماه برگزار کند. این کارگاه به صورت تئوری و عملی بوده و ساعات برگزاری کارگاه از 9 صبح تا 1 بعد از ظهر می باشد.

ادامه مطلب

کنترل کیفیت و آماده کردن دیتاهای NGS

ارزیابی کیفیت اولین مرحله در مسیر بیوانفورماتیک RNA-seq می باشد. اغلب، برای فیلتر کردن داده، حذف توالی با کیفیت پایین و یا بازها (پیرایش)، آداپتورها ، آلودگی ها ، overrepresented و یا تصحیح اشتباهات و برای اطمینان از داشتن نتیجه نهایی دقیق ، لازم است.

ادامه مطلب