در سال های اخیر همگام با پیدایش و توسعه سخت افزار ها و تکنولوژی های پایگاه داده ها روزانه تعداد فراوانی بانک های اطلاعاتی ترکیبات شیمیایی پیاده سازی و در معرض استفاده همگانی قرار میگیرند . در این میان به کار بردن روش های اصولی و استاندارد به منظور دست یابی به اهداف اساسی ذخیره سازی و بازیابی صحیح ، دقیق و با سهولت ترکیبات بیولوژیکی از درجه اهمیت بالایی برخور دار است.لذا طراحان متخصص و خبره بانک های اطلاعاتی ، مبانی و اصول نرمال سازی پايگاه داده را همواره در خلال طراحی به خاطر داشته و آن را به کار میگیرند . نرمال سازی فرآيندی در خلال طراحی پايگاه داده است كه با چهار هدف عمده ذيل دنبال می شود :
• به حداقل رسانی افزونگی اطلاعات
• به حداقل رسانی تغيير ساختار اطلاعات
• به حداقل رسانی I/O سرور به منظور کاهش تعداد تراکنش ها (Transactions)
تامین این اهداف در نهايت به حفظ يکپارچگی و سازگاری اطلاعات می انجامد که مستلزم رعایت نمودن اصول و تکنیک های فراوانی در مدلسازی و جزییات پیاده سازی بانک اطلاعاتی است.
گروه طراحی و توسعه بانک های اطلاعاتی آزمایشگاه پارس سیلیکو در همین راستا و در جهت تهیه و توسعه بانک های اطلاعاتی ترکیبات بیولوژیکی ، بیوشیمیایی و دارویی و اطلاعات ژنتیکی، امکان ارائه خدمات ذیل را با لحاظ نمودن اصول و ضوابط طراحی مطمئن و کارا ارائه می دهد.
· نگهداری اطلاعات واکنش های شیمیایی مولکولی حاوی مولکول های موقت میانی و محصولات نهایی
· تهیه و تولید اطلاعات مولکولهای کوچک همچون لیگاند و مولکولهای بزرگ همچون پروتئین و DNA
· امکان ذخیره و نمایش فرمت های استاندارد مانریس مجاورت همچون MDL، Molfile, PDB, CML
· امکان ذخیره و نمایش فرمت های خطی مولکولی همچون SMILES/SMARTS, SLN, WLN, InChI
· جستجو بر اساس کانفورمرهای گوناگون سه بعدی مولکول
· جستجو با لحاظ نمودن فیلترینگ بر روی انواع descriptorها از جمله moleculare weightو charge، solubility
· امکان جستجوی دقیق بر اساس ساختار یا با تعیین درصد مشابهت با ساختار مورد نظر با الگوریتم های مختلف Similarity
· امکان جستجوی بر روی مولکول ها بر اساس یک fragmentاز ساختار مولکولی
· امکان جستجو با مشخص نمودن sequenceخاص
· نگهداری ساختار مولکولی دوبعدی و سه بعدی بسته به نیاز و تبدیل به یکدیگر
· امکان لینک کردن و ارجاع دادن کاربران به سایر بانک های اطلاعاتی همچون Pubchemو NCBI
· امکان اجرای رابط کاربری تحت اندروید قابل استفاده روی Tabletو Mobile
· استفاده از ویرایشگر ترسیم ساختار مولکولی به صورت دوبعدی و سه بعدی
· استفاده از رابطه گرافیکی هوشمند با قابلیت راهنما و پیشنهاد خودکار
· امکان ایمپورت و اکسپورت دسته جمعی اطلاعات در قالب یک فایل XLSیا CSV
· امکان تبدیل انواع فرمت ها به یکدیگر و تولید دیتابیس یکپارچه از روی دیتابیس ها و فرمت های ناهمگون